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Master 2 - Spécialité Génétique et Gestion de la Biodiversité

Ce master professionnel est accessible sur demande après l'obtention d'une première année de master mention Biologie Moléculaire et Cellulaire à l'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6).

 

L'inscription se fait sur le site du master BMC à l'aide d'une fiche d'inscription remplie puis retournée au secrétariat (bat. K, 1er étage).

La capacité d'accueil de la spécialité est d'environ 12 étudiants.

 

Fiche de présentation

 

L'équipe pédagogique

Les enseignants-chercheurs qui vous suivrons et dispenserons les cours du premier semestre.

  • Mr Thierry Robert

    Tel : 01 69 15 79 89

    Mail : thierry.robert@u-psud.fr

     

    Responsable de la partie "génétique des populations"

  • Mr Aboubakry Sarr

    Tel : 01 44 27 36 84

    Mail : aboubakry.sarr@u-psud.fr

     

    Responsable de la partie "ressources génétiques"

  • Mme Evelyne Téoulé

    Tel : 01 30 83 33 06

    Mail : teoule@versailles.inra.fr

     

    Responsable de la partie "biotechnologies" et "génétique quantitative"

  • Mr Guillaume Achaz

     

    Mail : guillaume.achaz@upmc.fr

     

    Enseignant de la partie "génétique des populations"

  • Mr Bernard Billoud et Mme Ingrid Lafontaine

     

    Mail : bernard.billoud@upmc.fr

    Mail : ingrid.lafontaine@upmc.fr

     

    Responsables de la partie "bioinformatique"

  • Mr Philippe Lopez

     

    Mail : philippe.lopez@upmc.fr

     

    Responsable de l'UE "phylogénétique"

Objectifs du master

Vous souhaitez intégrer le milieu professionnel au niveau Bac + 5 en qualité d’ingénieur d’études, dans le secteur privé ou public, ou passer une thèse sur des questions fondamentales en relation avec la biodiversité, son évolution, sa conservation ou sa valorisation en industrie ou en amélioration des plantes ou des animaux.

 

Ce parcours, à vocation plutôt professionnalisante, a pour but de former des scientifiques de haut niveau possédant une maîtrise opérationnelle des méthodologies d'étude et de gestion de la biodiversité basée sur des connaissances intégrant des éléments issus de plusieurs champs disciplinaires : génétique fonctionnelle et évolutive, systématique moléculaire, génomique environnementale, écologie, statistiques. La formation proposée se caractérise par la recherche d'une certaine polyvalence dans la capacité à  mettre en œuvre des outils théoriques et des méthodologies de laboratoire pour l'étude de la diversité biologique d’organismes animaux, végétaux et microbiens.

 

Notre offre propose une formation pluridisciplinaire faisant intervenir des professionnels du secteur privé et des chercheurs et enseignants-chercheurs de l’Université Pierre et Marie Curie, mais aussi d’autres universités, d’écoles d’ingénieurs, de centres de recherche (CNRS, CIRAD, INRA, IFREMER,…) et d’organismes spécialisés (FRB, centres de ressources génétiques), tous impliqués dans la quantification, la valorisation et/ou la conservation de la biodiversité.

 

Les étudiants qui sortiront de cette formation devront pouvoir en toute autonomie :

 

  • Réaliser des analyses de polymorphisme (aux niveaux génétique, cytogénétique et phénotypique)
  • Concevoir des stratégies de collecte et de conservation de matériel biologique
  • Contribuer à la mise en place de réseaux de banques
  • Evaluer la Diversité de Taxons exploités pour des produits pharmaceutiques, aromatiques ou nutraceutiques et définir les bases génétiques de la production

Débouchés possibles après le master

Compte tenu des compétences et savoir-faire acquis, les étudiants issus de ce parcours de master peuvent intégrer divers secteurs professionnels.

 

Les secteurs d'activité intéressés par le profil de cette mention de Master sont nombreux, à titre d'exemples :

 

  • Entreprises privées de production végétale et agroalimentaire
  • Recherche secteurs agronomie, environnement et santé (INRA, IRD, CIRAD, Institut Pasteur)
  • Recherche universitaire académique (CNRS, Universités, Muséum, Zoos)
  • Collectivités locales et territoriales
  • Conservatoires botaniques et de ressources génétiques, parcs naturels
  • Secteur associatif (naturalistes, gestion de la biodiversité)
  • Industries pharmaceutiques
  • Bureaux d'études et administrations (DIREN)
  • Banques de gènes internationales
  • Instituts internationaux de recherche agronomique dépendant du CGIAR

Contenu des enseignements

Le premier semestre se compose de quatre UE obligatoires et d'une UE d'ouverture puis le second est un stage long.

Méthodologies d'analyse et de manipulation de la diversité

UE obligatoire et au plus gros coefficient, elle aborde notamment la génétique des populations illustrée par des études d'articles et des TD sur machine, les QTL, les travaux pratiques "étude de gènes candidats" et comporte aussi le mémoire réalisé en groupe d'étudiants sur un sujet au choix.

 

5V426 - 12 ECTS  (fiche UE)

T. Robert, G. Achaz, E. Téoulé

Méthodologies de gestion et de valorisation de la biodiversité

UE obligatoire qui va traiter surtout des aspects de ressources génétiques, de l'étude des marqueurs moléculaires, des nouvelles biotechnologies pour la génétique et aussi de la cytogénétique qui sera appliquée en travaux pratiques avec un modèle animal et végétal.

5V458 - 9 ECTS  (fiche UE)

A. Sarr, E. Téoulé

Phylogénétique - Introduction à la phylogénie moléculaire

UE obligatoire répartie sur une semaine de cours le matin avec des travaux dirigés l'après-midi pour appliquer les notions d'arbres phylogénétiques et leurs structurations avec des séquences protéiques selon différentes méthodes. L'évaluation de type "classique" à lieu le vendredi.

5V014 - 3 ECTS  (fiche UE)

P. Lopez

Analyses de données et Statistiques multidimensionnelles

UE obligatoire visant à fournir des rappels et un approfondissement des méthodes et notions de statistiques qui vont permettre de comprendre et surtout de représenter les jeux de données sur des espèces par exemple. On peut citer l'ANOVA, l'ACP, l'AFC...

Les cours sont illustrés par des exemples sur machine, avec utilisation du logiciel R.

5V470 - 3 ECTS  (fiche UE)

H. Rybarczyk, J. Mortillaro

Analyses de séquences et outils informatiques pour la biologie

UE considérée à part entière cette année, qui est constituée de cours théoriques sur les méthodes dites d'alignement de séquences, avec étude des scores de matrices, insertion de GAP, et illustrée par des exemples sur machine, avec environnement LINUX. L'évaluation est constituée d'une synthèse d'article avec soutenance orale par binôme.

OUVERTURE - 3 ECTS

B. Billoud, I. Lafontaine

Stage long en laboratoire ou dans une entreprise

Comptant pour l'intégralité du second semestre, il est réalisé soit en laboratoire de recherche, en entreprise (privée ou publique) ou dans des structures associatives. Il est accepté par l'équipe pédagogique et permet à l'étudiant d'appliquer de manière concrète les notions théoriques. Il est rémunéré et d'une durée allant de janvier à juin.

5V099 - 30 ECTS

Maitre de stage

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